#79 The Wizard of Fz

Broadの齋藤諒さん再登場。真核生物ゲノムにコードされたFanzorがRNAで標的をプログラム可能なエンドヌクレアーゼであることを示した論文、競合、ジョブハント、来年１月から理研で主宰予定のラボ運営方針について伺いました (8/31収録)
Show Notes (番組HP):

齋藤さん過去回 1 2
齋藤ラボ理研ECLページでの紹介
齋藤ラボ公募ページ（研究員・特別研究員）
齋藤ラボ公募ページ（パートタイマー・アルバイト）
理研　和光キャンパス　開拓研究本部
トークしたイベント
濡木先生
西増先生
井上梓先生
古館昌平さんの回 1 2

論文パート

Fanzor論文
最近のCell論文
Feng Zhangラボ
Cas9ゲノム編集論文
Cas9ゲノム編集＠ヒト細胞 1 2
Cas12
Cas13
Cas9祖先トランスポゾン論文
Eugene Koonin
OMEGA論文
CASTホーミングについての齋藤さん前報
平野清一さんのIsrB構造論文
ゲノム編集で病気も治るようになってきた
トマトでGABAを増やす
魚で白身を増やす
Jennifer Doudna達のFz論文
IS (Insertion Sequence)：転移に最低限必要な酵素のみを内部にコードするトランスポゾンの一種。それぞれ番号がついていて、転移機構も色々。
IS200/IS605
IS607
2013年のFanzor命名論文
AlphaFold
Omar Abudayyeh（おまー）
Jonathan Gootenberg（ぐーばー）
合同ラボ
BioRxivのプレプリントHERMES
Samuel Sternberg
のHERMESイジり
Science Advances論文
TnpBのペーパー
Virginijus Siksnys
Kavli賞
Soumya
Han
毛みたいなほわっとしたカビ
ATCC
ツボカビSpizellomyces punctatus
濡木先生とSiksnysのTnpBの構造論文 1 2
末端配列とガイドRNA(ωRNA)配列の関係：これのc
Spuのめっちゃ綺麗な末端配列：これのa
ツボカビにも一応エレクトロポレーションはある
PAM(Protospacer Adjacent Motif)：CRISPR-Casシステムにおいて、Cas9などのエフェクターがDNA切断を行う際に、標的配列の隣に必要とするモチーフ。SpCas9では3’側にNGG。
TAM(Target-Adjacent Motif)：OMEGAシステムには“Protospacer”という概念が存在しないため、このように呼ぶ。
TAM、トランスポゾン、ガイドとなっている：これのa
Peel-and-paste：これのb
Sam SternbergのSelfish Spreadの論文（機構はFig. 5g）
転写因子(TnpB様の転写抑制因子)の論文
OMEGAのペーパーが出た時のNews and Views
Robert Desimone
RSIの成果報告会で受賞したのが公表されたページ
CSHLのCRISPR Meeting
HanのTnpBのペーパー
CRISPR nuclease-protease
加藤一希先生
Jonathan StreckerとEsraのCRISPR associated endopeptidase論文
StreckerのCAST論文
Peiyu Xu
Guilhem Faure
COVID-19で一緒に働いた
Julia Joungの転写因子アトラス
Max WilkinsonのR2論文
R2レトロトランスポゾンのレビュー
R2を使った挿入ツール 1 2
David Liu
David LiuのtwinPE
Omar + Goober のPASTE
PASTEを基盤技術にしたTome Bioscienceの最近の動向
Jonathan Weissman
Cas活性のパラメータについての仕事の一例
登さん
Deliveryの話、例えばコレ
昔のラボメンはK99取ってた
マイキーのPEG10

ジョブハントパート

小関先生
医科研のUTOPIA
早稲田にいた時の自分の指導教官
UTOPIAについて一応調べた（100日でワクチン開発でした。。。 by齋藤） 
東大の真下先生
Cas3の論文
五神真先生
大阪大学の蛋白質研究所
定量研と卓越研究員制度
今年は加藤セチプログラムのみ
Max君は本当にすごい
Rockefellerインタビュー6人中2人がうちのラボ
Kalli
Helen Hay Whitney
Hanna Gray
Aviv Regev
Xiaowei Zhuang
Adam Cohen
マイキーのラボ
Max Wilkinsonの出身ラボ
Kalliの出身ラボ

独立後の計画

Joshua Weinstein
DNA Microscopy
Patrick Hsu
Bridge RNA
宮脇さんが有識者の回
有識者会議
科研費倍増への運動
後藤由希子先生
Kendall
スイスで会ったギタリストの友達
本田圭佑
HFSPミーティング
長田重一先生
アポトーシスの写真
二階堂先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
加藤英明先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
奥山先生　ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
Susan Gasser
Patrick Matthias
アセチル化やってた論文
吉田稔先生
古細菌テーマ＠HFSP
二段階になったHFSPフェローシップ申請（このReview Procedureタブを参照。Letters of IntentとFull Proposals）
Yi Zhang
小嶋さん
寺坂さん
松田真弥さん
松本さん
古館さんのNature論文
長井淳さん　飲みましょう！！！（by齋藤）
齋藤さんMITのアドレス

Editorial Notes:

夢をみることができなければ、未来を変えることはできません。— 華麗なる一族（TBSテレビ, 原作・山崎豊子, 2007）（齋藤）
理研の現地インタビューも茶髪で乗り込んだのかどうか気になる (萩原)
Shownotes大量に補足いただき大感謝です。今回もエナジェティックで非常に刺激を受けました、また是非！ (宮脇)