ZAIA總部的執行長裡昂亞克蘭德打算把ZAIA開發的獨立型士兵Humagear「索爾德」外銷到全世界各國，並用集體大腦系統控制他們的智慧，使他們無法達到技術奇點。裡昂利用亞絲交給他的驅動器變身成假面騎士ZAIA，與兩名索爾德士兵將迅綁走。為了救出迅，滅、亡、雷前往ZAIA日本分部，在集體大腦系統的刺激之下，進化成假面騎士滅亡迅雷，殊不知這一切其實都在裡昂的計劃之中…。